Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd1Q8VCZ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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