Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms