Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5rap2Q8K389 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms