Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc4a8Q8JZR6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms