Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx8Q8CFD4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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