Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vwa8Q8CC88 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vwa8Q8CC88 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms