Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim35Q8C006 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Trim35Q8C006 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Trim35Q8C006 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr1032-203ENSMUST00000111589 1393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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