Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efemp1Q8BPB5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efemp1Q8BPB5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 464.8 ms