Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Fbxo38Q8BMI0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms