Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf18Q8BM39 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prpf18Q8BM39 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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