Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms