Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup93Q8BJ71 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms