Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cyp4f39Q8BGU0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms