Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms