Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms