Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cracr2bQ80ZJ8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms