Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR3

Skida1, SKI/DACH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skida1Q80YR3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Cenpk-202ENSMUST00000070761 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Skida1Q80YR3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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