Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmcc2Q80W04 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmcc2Q80W04 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms