Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otop3Q80UF9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otop3Q80UF9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms