Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pja2Q80U04 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms