Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sgo2Q7TSY8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sgo2Q7TSY8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms