Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrc2bQ7TPM1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prrc2bQ7TPM1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms