Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stk40Q7TNL3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms