Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme8Q715T0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme8Q715T0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms