Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smpd4Q6ZPR5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms