Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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