Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tfap2eQ6VUP9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms