Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gja6Q6S5G4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gja6Q6S5G4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms