Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms