Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtifQ6PEE2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtifQ6PEE2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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