Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sarm1Q6PDS3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms