Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd7Q6PB75 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Papd7Q6PB75 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms