Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rexo4Q6PAQ4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms