Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1F6

Ppp2r2a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2aQ6P1F6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ppp2r2aQ6P1F6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ppp2r2aQ6P1F6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms