Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcd11Q6NS46 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd11Q6NS46 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms