Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scaf8Q6DID3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scaf8Q6DID3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms