Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fgd6Q69ZL1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd6Q69ZL1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms