Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprcapQ64697 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms