Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PtprdQ64487 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PtprdQ64487 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtprdQ64487 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PtprdQ64487 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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PtprdQ64487 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtprdQ64487 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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PtprdQ64487 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms