Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PtprjQ64455 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PtprjQ64455 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprjQ64455 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprjQ64455 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtprjQ64455 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprjQ64455 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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PtprjQ64455 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprjQ64455 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprjQ64455 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtprjQ64455 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PtprjQ64455 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PtprjQ64455 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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