Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja3Q64448 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja3Q64448 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms