Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim24Q64127 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim24Q64127 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms