Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col4a5Q63ZW6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col4a5Q63ZW6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms