Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcncQ62447 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms