Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phox2aQ62066 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms