Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Odf1Q61999 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms