Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifi47Q61635 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifi47Q61635 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms