Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lcp1Q61233 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms