Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Klf3Q60980 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms