Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tnfrsf8Q60846 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tnfrsf8Q60846 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tnfrsf8Q60846 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tnfrsf8Q60846 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf8Q60846 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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